Identifikasi Molekuler Trichoderma sp. Isolat T10 ISRI sebagai Agen Hayati Penyakit Busuk Akar dan Pangkal Batang Xylaria

Wiwit Wicaksono Jati, Ari Kristini, Agustin Sri Mulyatni, Abdul Latief Abadi

Abstract


Penyakit busuk akar dan pangkal batang pada tebu merupakan penyakit yang memiliki arti penting secara ekonomi.  Salah satu agen hayati yang berpotensi mengendalikan penyakit busuk akar dan pangkal batang Xylaria adalah Trichoderma sp. Isolat T10 ISRI memiliki aktivitas enzim kitinase yang tinggi sehingga dapat digunakan sebagai agen hayati. Identifikasi isolate T10 ISRI bertujuan agar potensi lain dari isolate T10 ISRI dapat diktahui. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi isolat T10 ISRI sampai dengan tingkat spesies melalui identifikasi secara molekuler. Metode identifikasi dilakukan dengan sequencing DNA melalui BLAST dan pembuatan pohon filogenik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa spesies isolat T10 ISRI yaitu Trichoderma asperellum dengan kesamaan 100% dengan strain Trichoderma asperellum T sum 66 dari data NCBI dan kedekatan dalam kelompok 0,00001 dari pada jarak diluar kelompok yaitu 0,3287.

Full Text:

PDF

References


Antari, N.M., Darmayasa, I.B.G. & Hardini, J. (2020) Efektivitas Trichoderma asperellum Dengan Mediator Pupuk Kandang Untuk Mengendalikan Penyakit Layu Fusarium Pada Tanaman Cabai Merah (Capsicum annum L.). Simbiosis, VIII (2): 63-71

Baldwin, B.G., Michael J.S., Porter, J.M., Martin F.W., Christoper S.C. & Michael J.D. (1995) The ITS Region of Nuclear Ribosomal DNA: A Valuable of Evidence on Angiosperm Phylogeny. Annals of the Missouri Garden (2): 247-277 p.

Benitez, T., Rincon, A.M., Limon, M.C. & Codon, A.C. (2004) Biocontrol Mechanisms of Trichoderma Strain. International Microbiologi. Vol 7:249-260 p.

El Komy, M. H., Saleh, A. A., Eranthodi, A. & Molan, Y.Y. (2015) Characterization of Novel Trichoderma asperellum Isolates to Select Effective Biocontrol Agents Against Tomato Fusarium Wilt. The plant pathology journal. 31(1), 50–60. https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.09.2014.0087

Fatiyah, E.L., Aruminingtyas, S., Widyarti, S., Rahayu, Y., Kusmowardhani, A., Hidayati & Harmaji (2006) Analisa Biologi Molekuler. JBUB. 88 p.

Fang, J.G., Hsieh, W.H. & Lee, C.S. (1994) Root and basal stem rot, a new disease of

sugarcane. In: Rao, G.P., Gillaspie Jr., A.G., Upadhyaya, P.P., Bergamin, A., Agnihotry, V.P. and Chen, C.T. eds. Current Trends in Sugarcane Pathology. International Books & Periodicals Supply Service. Delhi, India, 59–64

Hall, B.G. (2001) Phylogenetic Trees Made Easy: A How - To Manual for Molecular Biologists. Sinauer Associates, Inc. Sunderland, Massachusetts, USA. 197 p.

Hakkar, A.A., Rosmana, A. & Rahim, M.D. (2014) Pengendalian Penyakit Busuk Buah Phytophthora pada Kakao dengan Cendawan Endofit Trichoderma asperellum. Jurnal Fitopatologi Indonesia Vol 10 (5): 139-144 p.

Hermosa, R.,Viterbo, A., Chet, I. & Monte, E. (2012) Plant-beneficial effects of Trichoderma and of its genes. Microbiology (Reading, England). 158. 17-25. 10.1099/mic.0.052274-0.

Hooker W.J. (1981) Potato disease. The American Phytopathological Society, St paul

Minnesota USA. 125 pp.

Jati, W.W., Abadi, A.L., Aini, L.Q. & Djauhari, S. (2022) Screening of Trichoderma sp. Isolates Based on Antagonism and Chitinolytic Index Against Xylaria sp. J Trop Plant Pests Dis, 22: 55-67 p.

Maryono, T.A., Widiastuti, A. & Priatmodjo (2017) Penyakit Busuk Akar dan Pangkal Batang Tebu di Sumatra Selatan. Jurnal Fitopatologi Indonesia, 13: 67-71 p.

Maryono, T.A., Widiastuti, R.H., Murti, A. & Priatmodjo (2020) Identification and Characterization of the Causal Agent of Sugarcane Root and Basal Stem Rot in South Sumatra, Indonesia. Sugar Tech, 22:105-111. https://doi.org/10.1007/s12355-019-00749-2.

Sandy, Y.A., Djauhari, S. & Sektiono, A.W. (2016) Identifikasi Molekuler Jamur Antagonis Trichoderma harzianum Diisolasi dari Tanah Pertanian di Malang, Jawa Timur. Jurnal HPT (Hama Penyakit Tumbuhan), 3(3), pp.1–8. Diakses 12 Desember 2022 dari https://jurnalhpt.ub.ac.id/index.php/jhpt/article/view/194

Trillas, M.I., Casanova, E., Cotxarrera, L., Ordovás, J., Borrero, C. & Avilés, M. (2006) Composts from agricultural waste and the Trichoderma asperellum strain T-34 suppress Rhizoctonia solani in cucumber seedlings. Biological Control, 39(1), 32–38. P.

Yulianti, T. (2017). Perkembangan Penyakit Lapuk Akar dan Pangkal Batang Tebu (Xylaria warbugii) di Sumatera dan Strategi Pengendaliannya. Perspektif, Vol. 16 No. 2, 122-133 p.




DOI: https://doi.org/10.54256/isrj.v3i1.94

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Copyright (c) 2023 wiwit wicaksono jati, Ari Kristini, Agustin Sri Mulyatni

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Editorial Office:
Pusat Penelitian Perkebunan Gula Indonesia
Jl.Pahlawan Nomor 25 Pasuruan 67126, Indonesia
Telp:+62 0343 421086 ; Fax: +62 0343 421178
Email: p3gipasuruanok@gmail.com; web perusahaan:http://www.p3gi.co.id

Creative Commons License
Indonesian Sugar Research Journal (ISRJ) is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.